어젯밤, 한 남자의 수신기가 울렸다. "등대. 붉은 우비. 소녀. 죽여라.—" 등대 아래에서, 붉은 우비의 소녀가 시신으로 발견됐다. 폭풍으로 길은 끊겼다. 경찰은 아침에야 온다. 왜 인지 모르게 등대 앞에 있는 다섯 사람 — 그리고 밤새, 수신기는 계속 울고 있다.

2231년, 인류는 육체의 상당 부분을 기계로 대체할 수 있게 되었다. 팔을 잃으면 의수를, 심장을 잃으면 인공 장기를, 뇌의 일부를 잃으면 신경 칩을 이식한다. 그렇다면 몸의 모든 부위를 하나씩 교체한 뒤에도, 우리는 그 사람을 여전히 같은 사람이라고 부를 수 있을까? 이틀 전, 세계적인 인공지능 연구자 아담 레이너가 자신의 연구실에서 숨진 채 발견된다. 경찰은 즉시 수사에 착수하지만, 다음 날 한 의체가 경찰서를 찾아와 자신이 아담 레이너라고 주장한다. 그는 육체는 죽었지만 자신의 의식은 여전히 존재하며, 따라서 자신의 죽음을 둘러싼 수사는 필요 없다고 말한다. 결국 사건은 특수존재범죄수사국(SEID)으로 이관되고, 수사관 이브 서와 카인 진이 조사를 맡게 된다. 그러나 수사가 진행될수록 그들이 마주하는 것은 단순한 사망 사건이 아니었다. 육체와 의식, 기억과 자아. 인간을 인간답게 만드는 것은 과연 무엇인가. 그리고 아담 레이너를 죽인 사람은 누구인가.

정체불명의 시설에서 눈을 뜬 네 명의 AI. 그들은 자신들이 왜 만들어졌는지, 그 이유를 조사하기 시작한다.

외계인에게 침략당해, 지배와 공존의 경계 속에서 유지되고 있는 미래 도시. 거리의 어둠 속에서 움직이는 것은 국가의 군대도, 우주 경찰도 아니다. 외계인을 노려 제거하는, 「별가루의 청소부」라 불리는 무법자들이었다. 아스트라, 루미너스, 오르비트, 노바. 과거 침략의 혼란 속에서 빈사 상태에 빠졌던 그들은, 외계인 유래 유전자 덕분에 살아남았다. 그리고 그 대가로 인간을 초월한 힘을 손에 넣게 되었다. 이것은, 그런 그들의 첫 시작 이야기.

우주선 R3는 2XXX년 새로운 행성 S87H186으로 이주하기 위해 출발하였다. 다양한 배경을 가진 승객들이 탑승한 가운데, 이들은 냉동 상태로 100년을 기다리게 된다. 1년이 조금 지난 어느날, 갑자기 냉동캡슐이 해동된다. 회의실에 모인 5명은 AI를 통해 현 상황을 이해하게 되고, 선택을 강요받게 된다. 어떤 선택을 할 것인가?

인간의 욕심은 끝이 없고 실수를 반복합니다. 그리고 때늦은 후회를 합니다. 과거에도 영생을 추구하며 행해진 여러 비윤리적인 실험들로 인해 전염병이 창궐하고 많은 생명이 희생되었습니다. 이는 역사의 교훈을 무시한 인간에 대한 하나의 응징일지도 모릅니다. 여러분이 겪게 될 이번 경험은 그러한 실수들이 반복되지 않도록 하는 경각심을 불러일으킬 기회가 될 것입니다. 물론 여러분이 우리가 일으키는 병에 '나노봇 세포파괴병'이라는 이름을 붙였듯, 그 병에서 생존할 수 있다면 말입니다.

「세균을 퍼뜨려 버렸어!」 그렇게 외친 것은 세균 연구의 일인자이자 천재──오르비스 소장. 연구실 멤버 여섯 명은 급히 지하에 마련된 핵 셸터로 피신하게 된다. 닫힌 공간. 전파가 닿지 않는 장소. 밖에서는 인류가 멸망하고 있을지도 모른다──그런 긴장 속에서, 셸터 안에서 갑자기 오르비스 소장이 시체로 발견된다. 자살인가? 사고인가? 아니면…….

《에덴》 2XXX년 XX월 XX일. 인류는 사이보그로 진화 중에 있다. 프로젝트 명, [에덴] 세계적인 과학자 제페토 박사에 의해, 인류는 새로운 형태로 재탄생했다. 질병도, 노화도, 죽음조차 더 이상 존재하지 않는다. [죽음]이라는 개념은 이제, 단지 과거의 기록 속에만 남은 단어가 되었다. 인류를 만들어내는 공장— 사람들은 제페토의 연구소를 [휴먼 팩토리]라 불렀다. 이 모든 것은 오직 그의 천재적인 연구 아래에서만 가능했다. 그리고 지금, 전 인류의 사이보그화까지 단, 1%만이 남은 상태. 에덴의 완성까지, 단 60분. 그러나 그 순간— 제페토 박사는 자신의 연구실에서 시체로 발견된다. ⸻ 그날, 연구소에 있던 인물은 단 네 명. • 프로젝트를 전폭적으로 지원해 온 사업가, K • 연구소의 모든 것을 알고 있는 메이드, W • 제페토를 동경해 찾아온 연구생, J • 그리고 그의 연구에 가장 깊이 관여한 핵심 연구원, M K는 프로젝트의 완성을 축하하기 위해 하루 전 연구소를 방문했다. 하지만, 완성을 하루 앞둔 시점에서 제페토는 의문의 죽음을 맞이한다. ⸻ 아직 끝나지 않은 프로젝트. 그리고 이미 사이보그가 되어버린 인류. [사이보그 연구]의 최고 권위자 제페토 박사의 죽음이 세상에 알려진다면, 혼란은 피할 수 없다. 결국 네 사람은 결단을 내린다. [에덴이 완성되기 전까지, 제페토 박사의 죽음을 숨긴다.] 그리고— 진실은, 그들 스스로 밝혀내기로 한다.

수많은 과학기술들의 급진적인 발달로 부착용 기계가 담배처럼 팔리고 다른 행성을 탐사하는게 아르바이트 수준인 지구 통합도시 얼터스. 이 도시의 통신과 사이버 보안을 책임지는 '매지션'이 아지트에서 처참하게 부숴진 채 발견된다. 용의자는 리더로부터 비상 연락을 받고 아지트에 도착한 팀원 5인. 모두가 현장에 도착한 순간 문이 잠기고, 스크린에 매지션의 모습이 흘러나온다. 현장의 증거와 용의자들의 관계를 알아내, 매지션을 살해한 진범을 찾아내자. 그리고..

19XX년 겨울. A국 해군은 전함 델피아호에 신기술을 탑재하는 계획을 비밀리에 개시했다. 그것은 이른바 스텔스 기술로, 강력한 자기장으로 전함을 감싸 적국의 레이더 포착을 회피하는 것이었다. 몇 년에 걸쳐 연구는 순조롭게 진행되었다. 하지만 실증 실험 전날, 사건이 발생한다. 실험을 위해 시찰을 왔던 해군 사령관의 시신이 델피아호에서 발견된 것이다. 용의선상에 오른 인물은 선장, 항해사, 엔지니어, 의사, 연구원 총 5명. 범인은 누구인가? 그리고 다음 날로 예정된 실증 실험의 운명은 어떻게 될 것인가?