見知らぬ無人島と、見知らぬ人達。 アカシ、ユカリ、アオ、ハルカ、ミドリ―― 名前以外の手がかりもなく、どうしてここにいるのかさえ分からないまま、彼らは生き延びるために協力をはじめる。 だが、支配的な態度を振る舞うアカシの存在が、次第に空気を不穏に染めていく。 そして数日後―― 森の中で、アカシが血を流して倒れているのが発見された。 犯人は誰か？ なぜ、こんなことに？

「ここで終わらせる……私たち《ルミナス☆ハーツ》の――力で！！」 強敵《ナイトメア・オニキス》との最終決戦。 魔法少女たちは力を合わせ、壮絶な戦いを制した。 しかし、勝利の余韻に包まれる中―― 瓦礫の中でルミナス☆ルビーは、静かに倒れていた。 仲間を信じ、未来を信じ、最後まで戦い抜いた彼女。 だが、なぜルビーは命を落としたのか？