天皇家の赤子が生後50日の祝いを迎えんとしている。 無事に祝いをすませれば次の東宮（皇太子）になるとの噂だ。 祝いの前日、会場となる邸を4人の貴族が訪れた。 真夜中、悲鳴が響き渡り、4人は目覚める。 そして、矢が突き立った死体が見つかった！ 真相を探る権限は4人の貴族にのみあり、容疑者もまた彼らに絞られた……！ 手がかりは……和歌?!

西の領域で起きた事件の記憶が、まだ新しい頃。 東の領域を守護する7人の天使たちは、神の秩序のもと平穏を保っていた。 しかしある日、ひとりの天使が命を落とす。 これは、ありえないはずの天使殺し。 神は告げる。限られた時間の中で犯人を見つけ出せ、と。 疑念、後悔、隠された秘密。 裁きの時が迫る中、天使たちは真実へ辿り着くことができるのか。

研究所には5人の男女が集められていた。 共通するのは『能力』を持っていること。 5人が集まった施設で、誰かが発見する。 「……主任が、死んでいる」 閉ざされた施設、 迫りくる謎、殺人事件。 その間にも地球外生命体は 刻一刻と地球へと近づいていた。

2017年5月6日、ある凄惨な殺人事件が発生した。 現場で意識不明の重体となって見つかった女性・木村保奈美は、ついに取調室で刑事の亜門と対峙する。 静寂の中、二人は事件の記憶を一つずつ手繰り寄せ、議論を重ねていく。なぜ彼女が犯行に及んだのか、なぜ現場は完全な密室だったのか――。 しかし、謎を紐解いていくうちに、事態は誰も予想しなかった歪な方向へと傾き始める。 密閉された取調室で話し合う刑事と彼女が、最後に辿り着くあまりにも恐ろしい真相とは……。

舞台は世界的に有名な音楽家の豪邸。 そんな豪邸の主人が殺害された。 犯人は誰なのか。 「信頼を勝ち取るのは誰だ。」 「レゾリューションを奏でられるか。」

​西暦25XX年。 科学の境地に達したと驕る人類は、マリアナ海溝の底、深海10101メートルの闇に眠る新たな謎の発見に湧いた。 地球上にない未知の素材、未知の技術。太古の昔に宇宙から飛来したと推察される、巨大な構造物。 人類はEAV（Extraterrestrial Autonomous Vessel）と呼称し、100年という歳月を費やして解析、そして――自分たちの手足となるよう〝改造〟した。 こうして人類は悲願であった無限動力を備えた宇宙船を手に入れ、​長い眠りから醒めたEAVは、飛来したときとはまったく別の姿で故郷たる宇宙へ還った。 ところが―― テスト航行で月に向かっていたEAVの船内に、突如警報が鳴り響いた。 システムの誤作動か、裏切り者の仕業か、まだ実用段階に至っていないはずのワープシークエンスが作動したのだ。 コールドスリープから目を覚ました船員たちを待っていたのは、地球の星図には載っていない〝宇宙の彼方〟の光景だった。 ​閉ざされた宇宙船、不可解なワープ、そして―― 人類未踏の『宇宙の彼方にて』マーダーミステリーが始まろうとしていた。

その日、世界は崩壊した。 異変を察知した堂島と流星は、咄嗟の判断で船に飛び乗った。 なにも分からぬまま、行く宛もなく海を彷徨う2人。 「このクソ嵐が！もう、どうにでもなっちまえってんだ！！」 辿り着いたのは、ひとつの孤島。 逃れた人達が集う、外界から切り離された、最後の島。

ある日、謎の招待状により、４人の名探偵が集められる。 彼らは告げられる。「伝説の名探偵、九院 慧（くいん けい）の後継者となるための試験を行う。」と。 探偵たちは、自身の願いを叶えるため、試験の合格を目指す。

時は大正。 予告状を送りつけ、その通りに盗み去る。 大胆不敵、正体不明。 その名は怪盗亜瑠星奴（あるせいぬ）。 その人気たるや凄まじく、亜瑠星奴を主人公にした小説は飛ぶように売れ、映画は連日大入り満員。 事件の舞台は、とある森の奥に建てられた洋館。 資産家の主人は様々な物を集める癖があり、その館は蒐集館（しゅうしゅうかん）と呼ばれていた。 そして主人の今の興味は、もちろん怪盗亜瑠星奴。展示品は、金にものを言わせて集めた亜瑠星奴にまつわる品々。 招待されたのは、亜瑠星奴に関する人々。だがそこにはすでに予告状が届いていた。 「今宵、蒐集館の主人の命を頂戴する。怪盗亜瑠星奴」 館の主人は、亜瑠星奴に会えるとむしろ喜び、警察も呼ばずにパアテイを決行。 しかし有言実行亜瑠星奴、予告通りパアテイの最中に主人は遺体となって発見されたのだった。

王都で見つかった大富豪の遺書。 そこに記された南方の座標。付記された名は「夢の島」。 秘宝“ラプラスの鍵”を守るのは、天空を舞う怪鳥。挑む者は勇気と知恵のすべてを問われ、敗れた者は、二度と海へ戻らないという。 キャプテン・キッド率いる《フリーランズ》は、その伝説へ舵を切った。 胸にあるのは希望。 だが、奥底で名もない違和感が静かに波打っていた。 彼らを待つのは栄光か。それとも破滅か。 それを知るのは、海だけだ。