“여기는 미래 동물원. 이 동물원의 웨스트 구역에는 네 마리의 동물이 우리 속에서 살고 있었습니다. 인간들에게 어떤 종으로 불리고 있는지는, 서로 모릅니다. 하지만 네 마리는 각자의 특기를 살려 탈옥 계획을 세웠습니다. 그리고 오늘은 그 탈옥 계획을 실행에 옮기는 날! ……그런데, 아무래도 탈옥을 방해하려는 배신자 동물이 섞여 있는 것 같습니다. 모두 함께 자유를 얻을 수 있을까요?”

여기는 어느 무인도. 3주 전 비행기 사고에 휘말려 구조를 기다리던 두 사람에게, 이번엔 배 사고로 떠밀려온 세 사람이 합류하면서 다섯 명이 함께 생존 생활을 시작한다. 극한의 상황 속에서 그들은 충돌을 피하기 위해 서로의 접촉을 최소화한 채 식량을 나눠 먹으며 버티기로 결심한다. 그러던 어느 날, 생존자 중 한 명인 이치노세의 시신이 해변에 떠밀려오는 것이 발견된다.

동북 지역 이와테현에 위치한 '고드름 마을'. 부동 대학의 학생들은 이 마을에 전해 내려오는 '고드름 공주' 전승을 조사하기 위해 필드워크를 떠난다. 하지만 한 참가자가 전승 그대로 사망하고 마는데…?

때는 겐로쿠(元禄) 시대, 쇼군 츠나요시의 치세. 어느 깊은 산골의 외딴 마을에서 시신 한 구가 발견되었다. 시신의 상태는 참혹하기 그지없었다. 가슴부터 배에 걸친 살점이, 톱에 의해 집요하게 파헤쳐져 있었던 것이다. 누군가 말했다. 「〈톱귀신(鋸鬼)〉이 왔어……. 아아, 틀림없이 〈톱귀신〉의 짓이야……」 억수같이 쏟아지는 소나기에 고립된 마을에서, 각자의 의도가 교차한다.

어사일럼(정신병원). 그곳은 이상한 주민들로 가득 찬 원더랜드. 언제나 모자를 쓰고 있는 모자장수, 늘 웃고 있는 체셔 고양이, 모두를 군림하는 여왕, 그리고 꿈틀꿈틀 기어다니는 애벌레. 이런 이상한 나라에 찾아온 상상력이 풍부한 소녀 앨리스. 1889년 영국. 연쇄 살인마 ‘잭 더 리퍼’ 사건이 세상을 떠들썩하게 하던 중, 런던 교외의 어사일럼에서 앨리스와 친구들은 오늘도 특이한 나날을 보내고 있었다. 그러던 어느 날, 앨리스와 친구들이 크로케를 하고 있을 때 소동이 일어난다. "애벌레가 죽었어!" 애벌레를 죽일 수 있었던 건 앨리스, 모자장수, 체셔 고양이, 여왕, 이 네 명뿐. 앨리스는 놀라고, 모자장수는 당황하며, 체셔 고양이는 미소를 지었다. 여왕은 잠시 생각한 뒤 엄숙하게 선언했다. “이 안에 범인이 있다면, 바로 잡아야 합니다. 밝혀내서 구속해야 해요.” 모두 고개를 끄덕이며 이야기를 나누기 시작했다.

200X년, 일본. 경찰조차 손을 쓰지 못하는 난해한 사건들을 순식간에 해결로 이끌던 ‘명탐정’이 있었다. 그 탐정의 이름은 카무이 소스케. 살을 찌르는 듯한 냉기가 감도는 어느 겨울날 — 소스케에 의해 외딴섬의 저택에 모인 것은 네 명의 초대 손님들이었다. “지금부터 일어날 사건을 해결한 자에게, ‘카무이’의 재산을 물려주겠다.” 막대한 부와 명성을 한 번에 손에 넣을 수 있는 절호의 기회. 초대 손님들은 저택에 머물며 사건이 일어나기를 기다린다. 날이 밝는다. 의심스러운 소리에 이끌려 달려간 그곳에는, 카무이 소스케의 처참한 시신이 쓰러져 있었다. 이것은 피로 이어진 숙명을 둘러싼 이야기이다.

지구력 2873년. 테라포밍 기술의 발전으로 인해 인류의 거주지는 태양계를 넘어 확장되었고, 인류는 수십 개의 별에 흩어져 살아가고 있었다. 정착 초기에는 자원을 둘러싼 다툼이 끊이지 않았으나, 각 별의 유력자들이 모여 "인류총회의"를 설립하고 각 지역의 전쟁을 평정하였다. 현재는 반란 행동도 극소수에 불과하다. 그 해 겨울, 쌍둥이자리 유성우를 관측하던 천문대가 유성우 속에서 하나의 메시지를 발견한다. "휴먼 여러분, 안녕하세요. 저희 별로 와주세요." 외우주의 지적 생명체로부터 온 것으로 보이는 메시지에 사람들은 크게 들떴다. 인류총회의는 즉시 외우주 탐사 계획 《프로젝트 제미니》를 발족하고, 메시지에 표시된 좌표로 우주선 제미니호를 보내기로 결정했다. 제미니호는 콜드슬립 상태의 승객들과 5명의 승무원을 태우고 목적지를 향해 여정을 계속한다. 그러나 평온한 일상은 선내에 울려 퍼진 비명소리로 인해 산산이 부서졌다. 급히 달려간 승무원이 발견한 것은, 등 뒤에 단검이 꽂힌 채 죽어 있는 선장의 시체였다. 선장은 왜 죽었는가? 의혹이 휘몰아치는 제미니호의 미래는 어떻게 될 것인가? 그 우주선은, 희망과 악의를 동등하게 싣고 나아간다.