戦争があったのは遥か昔のこと。機関車が走り始め、大陸の移動が容易になりつつある時代。人里離れた屋敷で、魔法研究の第一人者オリバー・ブラウンが殺された。 彼が生前研究していたものは、錬金術の究極の到達点「賢者の石」だという。しかし、それは事件とともに消え、屋敷にいた客人たちは全員、容疑者となる。 だが、この事件の裏には、もうひとつの真実が隠されていた。 　 運命を決めるのは、あなたの選択。

とある高校の仲良し4人組のひとり、及川千尋のクッキーが消えていた。 犯人はいったい誰？